۱- توسعه پژوهش در حوزه اخلاق و تاریخ پزشکی
۲- ارتقا و توسعه آموزش اخلاق پزشکی
۳- تحقق و کاربردی کردن موازین اخلاقی در نظام سلامت کشور
۴- توسعه همکاری‌ها و ارتباطات ملی و بین‌المللی در زمینه اخلاق و تاریخ پزشکی
۵- ارتقا بهره‌وری ساختار و منابع مرکز